Aciduliprofundum boonei è una sorta di arco termoacidófila il bordo Euryarchaeota . È stato isolato da fonti hidrotermalesl acide. A. boonei è il primo membro della sua clade , di arqueaa termoacidófila conosciutoprofondo-Sea idrotermale Vent Euryarchaeota 2 (DHVE2) da coltivare.

morfologia e fisiologia Ceulular

A. boonei è un must termoacidófila cresce a pH 3,3-5,8, 4,2-4,8 con la zona ottimale. Sono stati osservati per colture tra 55-77 ° C con una migliore crescita a 70 ° C con insaturi di sale di 2,5-3,5% (w / v). 1

Morfologicamente, questo arco è una noce di cocco pleiomórfico con diametro delle cellule di 0,6-1,0 micron. Le cellule sono mobili da una flagelli e sono avvolti da una membrana plasmatica ed uno strato S con una struttura simile a Picrophilus oshimae .

Anche se molte persone credono che gli strati S sono quasi – cristallino , quello di A. boonei ha una notevole plasticità e può essere piegato e curvo in piccole strutture che assomigliano vescicole . 2Queste strutture spuntano fuori della membrana cellulare, sequestrando piccole porzioni di citoplasma e si uniscono con altre cellule recinzioni. Tali vescicole sono stati osservati germinazione in catene da microscopio elettronico a trasmissione . In altre specie di batteri e fiocchi, si vescicole come stai rimuovere le proteine mal ripiegate e tossine . Inoltre transladam mRNA , facilitare la comunicazione cellulare , e fornire fattori di virulenza . Biogeochimica importanza del processo di germinazione energia non è stato ancora determinato in questa specie.

Altre analisi chimiche hanno dimostrato che la loro lipidi di membrana composta principalmente da glicerolo dibifanil tetraéteres glicerolo con 0-4 cicli di ciclopentano. Questa struttura biochimica è probabilmente un segno distintivo della Crenarchaeota e Euryarchaeota acidophilus, e sono stati rilevati nei parenti più stretti di A. boonei , Ferroplasma e Thermoplasma .

Ambiente ed ecologia

Questo Arque termoacidófila è stato isolato solo da fonti idrotermali con ambienti marini bentonici. In particolare, A. boonei esiste in campioni prelevati dalle flange orizzontali di camini sporgenti dal fondo del mare. È possibile che il trasferimento di calore e la diffusione del fluido crea una nicchia ecologica ottimale per la reversibilità di questo organismo nell’ambiente duro. Questi ambienti sono estremamente inospitale per gli esseri viventi e metabolismo della domanda e comportamento unico. sorgenti idrotermali sono tipicamente calde, con l’ossigeno tossici e riduzione limitata, limitando gli organismi di colonizzazione in grado di sopravvivere in queste condizioni difficili. Di conseguenza, gli organismi si trovano in questo ambiente sono in genere estremofili come termofila , acidofile , alofila e barophiles e piezophiles .

Questo ambiente idrotermale è ricco di zolfo e ferro metaboliti che sono utilizzati da una varietà di organismi Lithotrophic come accettori e donatori di elettroni . In trasformato out , questo ambiente permette un’ampia gamma di processi metabolici che si basano su gradienti termici e chimici.

Metabolismo

Perché è strettamente anaerobico, A. boonei richiede restrittive anossiche piccole nicchie per sopravvivere. Gode di un approvvigionamento continuo di elettroni come accettori di inorganico dello zolfo elementare di zolfo e ferro ferrico. I processi geofisici e geochimici che si verificano sotto la corteccia e nel fluido che inondano bocche idrotermali bentonici creano condizioni che favoriscono la crescita di A. boonei .

Questo Arque è strettamente eterotrofi che fermenta peptidi per l’energia. Gli studi del genoma ha rivelato la presenza di più enzimi proteolitici e peptolíticos. La ricostruzione del genoma ha rivelato percorso completo, ma ha modificato tramite il Embden-Meyerof-Parnas che operano in gluconeogenesi .

Secondo ecologie che studiano bocche idrotermali, e ridotti ambienti anossici in cui A. boonei vite sono modellate dal sinergie che A. boonei ha con altri organismi che vivono da queste parti. studi di genomica meustran altri membri del clade che si verificano interamente accanto altri termoacidófilas archeobatteri utilizzando altre fonti di carbonio e di energia. 3

Genoma

Poiché esso è difficile da coltivare A. boonei , ci sono stati molti studi di questo tipo e altri membri della clade in livello genomico. Polymerase chain reaction cuantativa è stata utilizzata per rilevare le sequenze di campioni raccolti arcaiche fonti idrotermali in tutto il mondo. 4 L’analisi del gene 16S rRNA permesso la ricostruzione filogenetica di DHVE2 e altri termofili Archaea ramificazioni profonde spesso si trovano in un ambiente idrotermale centrale. Sono stati costruiti alberi filogenetici per dimostrare visivamente la novità e il gruppo DHVE2 A. boonei .

Il progetto del genoma di A. boonei T469 era di 31 impalcature con una media di circa 47 KBP dimensioni, con contenuto di GC del 39%. La ricostruzione prodotto una mappa di geni coinvolti nella formazione di flagelli, e ha dimostrato che il corpo è stato organizzato simile ai geni flagellari in modo archeobatteri; FLA1 e PLA2 . Il terzo modello di organizzazione flagellare era simile a FLA1 e PLA2 , ma mancava componenti specifici. Ciò suggerisce che sia l’evoluzione riduttiva e trasferimento genico orizzontale possono aver giocato un ruolo nella acquisizione di geni flagellari da A. boonei .

Discovery e l’isolamento

Questo arco è stato isolato nei campioni di zolfo raccolti durante le spedizioni di immersione nel Lau orientale Diffusione Centro, nell’ambito di un progetto di ricerca condotto da Anna-Louis Reysenbach nel 2006. Nonostante la difficoltà di isolare altra classe archeobatteri DHVE2 di questi ambienti di sfogo idrotermali, un boonei è stato isolato ambiente marino in ultima analisi, in condizioni anaerobiche e acidi che hanno impedito la crescita di Thermoplasma volcanium spesso compensa A. boonei . Poi il corpo è stato anche isolato da campioni del Pacifico orientale e Mid – Atlantic Ridge .

L’eziologia

Il nome “Aciduliprofundum” deriva dal acidulata ( latina ), “un po ‘amaro”; e profundum (latino), “profondo”, per la sua natura e la posizione acidophilus bentonici. “Boonei” (latino), “Boone,” è in riferimento a David Boone che ha fatto significativi contributi per lo studio della diversità arcaica.

Riferimenti

  1. Torna a inizio pagina↑ Reysenbach AL, Liu Y, Banta A, Beveridge T, J Kirshtein, Schouten S, M Tivey, Von Damm K, M Voytek 2006. Un archaeon thermoacidophilic onnipresente da sorgenti idrotermali d’altura. Natura. 442 : 444-447
  2. Torna a inizio pagina↑ Reysenbach AL, Flores G. 2008. Electron Incontri di microscopia con thermoacidophiles insolite analisi genomica diretta di Aiuta Aciduliprofundum boonei . Geobiol. ” ‘6’ ”: 331-336
  3. Torna a inizio pagina↑ Flores G, Wagner io, Liu Y, Reysenbach AL. 2012. Distribuzione, modelli di abbondanza, e la diversità del thermoacidophilc “altura idrotermale vent Euryarchaeota 2” Fron Microbiol. 3 : 1-17
  4. Torna a inizio pagina↑ Takai K, K Horikosh . 1999. diversità genetica di Archaea in altura idrotermali Vent ambienti. Genetica. 152 : 1285-1297