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archaeoglobi


I arqueoglobos ( archaeoglobi ) sono una classe di archeobatteri il bordo Euryarchaeota . Tutti i generi conosciuti sono ipertermofili e possono essere trovati nei pressi di sorgenti idrotermali sott’acqua. Mentre tutti i generi sono correlati filogeneticamente , il metabolismo utilizzato da ciascuno è unico. Archaeoglobus è quimiorganotrofo riduttore solfato , l’unico membro conosciuto del Archaea che hanno questo tipo di metabolismo. Ferroglobus , tuttavia, è un organismo qumiolitotrofo che combina l’ossidazione del ferro ferroso con ridotta nitrato . Geoglobus è un ferro riduzione dei gas archeobatteri utilizzando idrogeno o composti organici come fonti di energia.

Acidiplasma


Acidiplasma è un genere all’interno del phylum Euryarchaeota ( Archaea ). 1

Etimologia

Il nome Acidiplasma derivato da:
latino moderno genere neutro acidum un acido ; Greca genere neutro sostantivo plasma (πλάσμα) , qualcosa di stampato; Moderna Latina neutro sostantivo Acidiplasma una forma che ama l’acido. 2

Specie

Il genere contiene due specie (compresi basófonos e sinonimi), in particolare 2

  • A. aeolicum (Golyshina et al. 2009 ( specie tipo del genere), Latina genere aggettivo neutro aeolicum , l’ arcipelago delle Eolie , che contiene Isola di Vulcano , dove è stato isolato il ceppo) 3
  • A. cupricumulans ((Hawkes et al. 2008) Golyshina et al. 2009; sostanziale Latina Cuprum , rame ; latini aggettivo participio cumulans , accumulando, latino participio moderni aggettivo cupricumulans , che si accumula rame) 3

Riferimenti

  1. Torna a inizio pagina↑ Euzéby, JP (1997). “Classificazione di entrata Genera AC in LPSN” . Int J Syst Bacteriol 47 (2). Elenco dei nomi batterici con in piedi in nomenclatura: una cartella disponibile su Internet. pp. 590-2. doi : 10,1099 / 00207713-47-2-590 . ISSN  0020-7713 . PMID  9.103.655 .
  2. ↑ Vai a:un b Euzéby, JP (1997). “Acidiplasma”. Int J Syst Bacteriol 47 (2). Elenco dei nomi batterici con in piedi in nomenclatura: una cartella disponibile su Internet. pp. 590-2. doi : 10,1099 / 00207713-47-2-590 . ISSN  0020-7713 . PMID  9.103.655 .
  3. ↑ Vai a:un b Golyshina, OV; Yakimov, MM; Lunsdorf, H.; Ferrer, M., Nimtz, M., Timmis, KN; Wray, V.; Tindall, BJ et al. (2009). “Gene aeolicum Acidiplasma. Novembre, sp. Novembre, a euryarchaeon della famiglia Ferroplasmaceae isolata da un pool idrotermale, e il trasferimento di cupricumulans Ferroplasma per Acidiplasma cupricumulans pettine. Novembre “. International Journal di sistematica e Evolutionary Microbiology 59 (11): 2815-2823. doi : 10,1099 / ijs.0.009639-0 .

Euryarchaeota

I euriarqueotas ( Euryarcheota ) o euriotas 1 è un bordo (e anche un superphylum o Unito ) del dominio Archaea . Si tratta di uno dei due gruppi principali di archeobatteri e originariamente era separata dall’altra gruppo ( Crenarchaeota ) sulla base delle sequenze di rRNA . Essi sono procarioti semplici e coprono una vasta e diversificata set microrganismi .

Classificazione

Siamo in grado di distinguere i seguenti gruppi di euriarqueotas:

estremità alofila

Questi archeobatteri appartengono alla classe halobacteria . Vivono in ambienti estremamente saline, laghi salati, piscine di acqua di mare evaporazione, serbatoi sotterranei salini, ma ora anche sulle superfici di alimenti altamente salati come il salato pesce e carne. Altri alofite microrganismi (funghi, gamberetti, ecc) hanno normali concentrazioni saline citoplasmatici, la spesa di energia definitivamente fuori il sale di fuori della cellula e l’acqua al suo interno. Questi archaea, può vivono a elevate concentrazioni di sali , e hanno il vantaggio di avere la stessa concentrazione di sale all’interno delle cellule che fuori. Pertanto, per sopravvivere hanno bisogno di soluzioni con un sale del 9%, ma la maggior parte specie preferiscono 12-23% e possono sopravvivere con concentrazioni di 32% di sale.

Il halobacteria ha la caratteristica unica di utilizzare la luce come fonte di energia, senza clorofilla . Per fare possedere un pigmento chiamato batteriorodopsina (simile al rodopsina il funzionamento retina dei vertebrati) che dà una membrana viola e reagisce con la luce producendo un gradiente protonico attraverso la membrana che li permette sintesi di ATP . Si compone di una ventina di generi.

Methanogens

Articolo principale: methanogen

Questo è un vasto gruppo di archeobatteri che producono metano come parte del loro metabolismo. Esso comprende classi metanobatteri , Methanococci , Methanomicrobia e Methanopyri . Essi sono ampiamente distribuiti in sedimenti, paludi anossiche, laghi, sorgenti idrotermali , delle acque reflue e anche nel rumine dei mammiferi ungulati, intestino di cani e gli esseri umani e la hindgut (o proctodeo) di insetti come le termiti e scarafaggi. In contrasto con la loro grande diversità filogenetica, può utilizzare solo alcuni substrati semplici, la maggior parte dei loro composti C 1 e H 2 / CO 2 , methanoate, metanolo o metilammina, anche se qualsiasi particolare specie è solo in grado di utilizzare due o tre degli loro. Alcuni di loro sono anche ipertermofili o acidophilus. Si compone di una trentina di generi.

Acidophilus finisce

Articolo principale: Thermoplasmata

È un piccolo gruppo di organismi (classe Thermoplasmata) contenente le note hiperacidófilos più estreme, Picrophilus, con un pH ottimale di 0.7, in grado di crescere e morire -0.06 a valori di pH superiori a 4.0. La maggior parte sono termofili e vivono in sorgenti sulfuree e mucchi di carbone ardente. Esso comprende genere Ferroplasma , Picrophilus e Thermoplasma .

Ipertermofili

Articolo principale: ipertermofilo

Si tratta di un piccolo gruppo di organismi che vivono in ambienti estremamente caldi, come bocche idrotermali, sedimenti abissali calde e depositi di olio caldo. Include classi archaeoglobi e thermococci , oltre ad alcuni methanogens e acidophilus. La crescita ottimale e sopra la temperatura di 80 ° C, sostenendo Pyrococcus una temperatura massima di 105 ° C. La maggior parte preferisce un pH neutro, anche se Thermococcus alcaliphilus ha un pH ottimale 9,0 e un massimo di 10,5. Esso comprende genere Archaeoglobus , ferroglobus , geoglobus (classe archaeoglobi ), Palaeococcus , Pyrococcus e Thermococcus (classe thermococci ).

Planctonici

L’analisi delle sequenze di rRNA contenute nell’acqua di mare suggeriscono che archeobatteri sono una parte importante del plancton dell’oceano. Queste sequenze geniche sono stati classificati in quattro gruppi, i primi due sono i più diffusi. I gruppo compreso nel Crenarchaeota , mentre le rimanenti tre sono inclusi nel Euryarchaeota. Gruppo II è più abbondante nelle acque di superficie ed è perifericamente relativi alla Thermoplasmata . Gli altri due gruppi appaiono per essere meno abbondanti. Il gruppo III è stato trovato in acque al di sotto della zona fotica ed è anche in relazione alla Thermoplasmata . Gruppo IV è stato scoperto dal professor Francisco Rodriguez-Valera ei suoi colleghi presso l’Università Miguel Hernandez (Spagna). E sembra che abitano le acque oceaniche profonde, perché non sono stati rilevati in superficie e un altro nelle parti più profonde della colonna d’acqua.

Cladogrammi

La filogenesi del 16S rRNA può essere dedotto che l’ultimo antenato comune euriota dovrebbe essere un methanogen , ottenendo i seguenti risultati: 2

l’ altra mano, la proteina analisi filogenetica suggerisce anche che la metanogenesi è molto antica, sarebbe quasi 3.500 milioni di anni, ottenendo la seguente cladogram: 3

Riferimenti

  1. Torna a inizio pagina↑ CR Woese, Kandler e ML Wheelis O. 1990, “Verso un sistema naturale di organismi: Proposta per i domini” Proc. Nati. Acad. Sci. USA Vol. 87, pp. 4576-4579, giugno 1990
  2. Torna alla cima↑ Il All-Specie viventi Albero (uscita LTPs111)
  3. Torna a inizio pagina↑ Fabia U. S. Blair Hedges Battistuzzi e il 2008. La maggiore Clade di procarioti con adattamenti antichi per la vita sulla Terra. Evol Mol Biol (2009) 26 (2): 335-343. doi: 10.1093 / molbev / msn247

Thermoproteus

Thermoproteus è un genere di archeobatteri dei ordine termoproteales . Questi procarioti sono termofile dipendenti solfuri connessi con i generi Sulfolobus , Pyrodictium e Desulfurococcus . 1 sono autotrofi e estremofili , possono crescere in temperature di oltre 95  ° C . 2

Riferimenti

  1. Torna a inizio pagina↑ Woese C, G. Olsen “archaebacterial filogenesi:. Prospettive sulle urkingdoms”. Syst Appl Microbiol 7 : 161-177. PMID 11.542.063 .
  2. Torna a inizio pagina↑ Messner P, Pum D Sara M, Stetter K, Sleytr U (1986). “Ultrastruttura della busta cella del tenax archeobatteri Thermoproteus e Thermoproteus neutrophilus.” . J Bacteriol 166 (3): 1046-1054. PMID 3.086.286 .

Thermoproteales

I termoproteales ( Thermoproteales ) sono un ordine di archeobatteri il bordo Crenarchaeota . Essi sono microrganismi che vivono un pH neutro o leggermente acido . La sua temperatura ottimale di crescita è 85-100 ° C e massima di 95-104 ° C. Fatta eccezione per Pyrobaculum aerophilum è aerobica , altri sono anaerobica rigorosa. La maggior parte sono nelle sorgenti calde continentali, ma Pyrobaculum aerophilum vive a sorgenti idrotermali nel fondo dell’oceano.

In generale, essi sono eterotrofi che ottengono l’energia necessaria riducendo zolfo di solfuro di idrogeno (H 2 S) utilizza composti organici come substrati, ma alcuni possono anche crescere qumiolitotróficamente utilizzando l’idrogeno (H 2 ) come un donatore di elettroni per la riduzione zolfo. Al contrario, Pyrobaculum aerophilum è inibita dalla presenza di zolfo e crescere autotrophically per ossidazione di idrogeno o tiosolfato , usando nitrati o nitriti come accettori di elettroni o heterotrophically utilizza composti organici in la presenza di nitrati.

THERMOPROTEACEAE

I termoproteáceas ( THERMOPROTEACEAE ) sono una famiglia di archeobatteri di ordine Thermoproteales .

Tassonomia

La famiglia THERMOPROTEACEAE comprende cinque generi :

  • Thermoproteus
  • Pyrobaculum
  • Thermocladium
  • Caldivirga
  • Vulcanisaeta

Sulfolobus

Sulfolobus è un genere di archeobatteri l’ ordine Sulfolobales crescita in sorgenti d’acqua calda e fare meglio quando viun pH compreso tra 2 e 3, e le temperature compreso tra 75 e 80 ° C, che li rende acidofile e ipertermofilo . Le cellule del Sulfolobus forma irregolare e sono frustati . metabolismo aerobico è opzionale e può commutare tra l’uso di ossigeno nella respirazione o comportarsi come chemotrophs utilizzando varie specie di zolfo .

Specie Sulfolobus sono globalmente con il luogo in cui essi sono stati isolati. Un esempio è S. solfataricus , che è stato isolato nel vulcano Solfatara , nei pressi di Napoli , Italia. Alcune specie, come S. islandicus , possono essere trovati in tutto il mondo in aree dove vulcanica o attività geotermica.

Nella ricerca, diverse specie di Sulfolobus sono utilizzati come modelli crenarquea. Sono inoltre ospita numerose e varie morfologicamente virus .

Sulfolobales

Il Sulfolobales ( Sulfolobales ) sono un ordine di archeobatteri il bordo Crenarchaeota . Sono microrganismi acidophilus con un pH ottimale tra 1,5 e 4. Essi sono generalmente meno termofili di Thermoproteales e thermococci , con una temperatura ottimale tra 65 e 90 ° C e solo Acidianus possono crescere a temperature superiori a 90 ° C. Sulfolobus e Metallosphaera sono aerobiche , Acidianus e Sulfurisphaera sono anaerobi facoltativi e Stygiolobus è un anaerobio obbligato. Essi vivono generalmente in sorgenti sulfuree continentali anche se alcune specie si trovano nei pressi di sorgenti idrotermali mare.

Tipicamente crescere ossidazione di zolfo per acido solforico . Le specie del genere Acidianus anche crescere anaerobicamente dalla riduzione dello zolfo a solfuro di idrogeno (H 2 S) utilizzando l’idrogeno (H 2 ) come un donatore di elettroni.

Staphylothermus marinus

marinus Staphylothermus è una sorta di arco di ordine Desulfurococcales . È un marine ipertermofilo microorganismo anaerobica rigorosa e dipendente zolfo elementare. Isolato da sedimenti e sfiati geotermicifondo dell’oceano. La temperatura ottimale di crescita in terreno minimo è di 85 ° C, mentre in media arricchito è 92 ° C. zolfo elementare è assolutamente necessaria per la crescita e diventa solfuro di idrogeno come prodotto di scarto. Una fonte di nutrienti complessi come estratto di lievito, peptone, estratto di carne oè necessario per la crescita anche.

Morfologia

S. marinus ha una morfologia insolita. A basse concentrazioni di nutrienti diametro cella varia 0,5-1,0 mm uva e grandi gruppi di fino a 100 cellule sono formate, mentre ad alte concentrazioni di nutrienti predominano cellule giganti con diametro fino a 15 mm . La parete cellulare ha anche una struttura inusuale composta da un complesso di glicoproteine chiamati tetrabrachion, che è stabile a temperature elevate e resistenti ai trattamenti chimici che spesso denaturano proteine. Tetrabrachion è composta da uno stelo attaccato alla membrana ad un’estremità e con quattro bracci proiettati perpendicolarmente dall’altra estremità. I bracci interagiscono con altre subunità tetrabrachion per formare un reticolo che copre la cella.

Speciali caratteristiche

S. marinus appartiene a Desulfurococcales fine anche di Aeropyrum PERNIX , la cui sequenza del genoma è stato determinato che rende il confronto possibile tra i due microrganismi. Entrambi gli organismi sono ipertermofilo richiedono esigenze nutrizionali complesse, ma mentre S. Marino è un anaerobio rigorosa che richiede di zolfo per la crescita, A. PERNIX è un aerobio rigoroso che non richiede composti dello zolfo.

Riferimenti

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Staphylothermus

Staphylothermus è un genere di Desulfurococcaceae . 1 che ha due specie descritte hellenicus Staphylothermus e Staphylothermus marinus

Riferimenti

  1. Torna alla cima↑ NCBI (2011). Sito su Staphylothermus . Dati tratti da “risorse tassonomia NCBI” . National Center for Biotechnology Information . Estratto 17 dicembre 2011 .

Riferimenti

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